Քանաքեռի Սուրբ Հակոբ եկեղեցին կառուցվել է XVII դարի վերջին՝ 1679 թվականի երկրաշարժի ժամանակ կործանված եկեղեցու տեղում՝ թիֆլիսաբնակ քանաքեռցի մեծահարուստ Հակոբջանի միջոցներով։ Սբ. Հակոբը թեմական եկեղեցի էր։ 1868 թվից եկեղեցուն կից սկսել է գործել Սահակ Պարթևի անվան թեմական դպրոց, որը կազմակերպել էր Մեսրոբ վարդապետ Սմբատյանցը։ Սբ. Հակոբ եկեղեցին պատկանում է եռանավ բազիլիկ տիպին՝ աղոթասրահում երկու զույգ մույթերով, արևելյան կողմից ավագ խորանով և դրան կից զույգ ավանդատներով:
Եկեղեցու արևմտյան ճակատին տեղ-տեղ ագուցված են գեղաքանդակ խաչքարեր՝ 1504,1571,1621 թվագրություններով։ Աստվածմերժության տարիներին Սբ. Հակոբ եկեղեցին դադարել է գործելուց և ծառայում էր որպես պահեստ։ Հետագայում այն պետական միջոցներով հիմնական վերանորոգման ենթարկվեց և 1990 թվականից դարձավ գործող, վերստին իր դռները բացելով հավատացյալների առաջ։